RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 ZANQ9Y493 2812 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-11P01762 117 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 LAGE3Q14657 143 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 M0R381 172 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 GCSHP23434 173 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 EPG5Q9HCE0 2579 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 DPM2O94777 84 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 LY6EQ16553 131 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 RASL10AQ92737 203 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 ACACBO00763 2458 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV1-69P01742 117 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 HIGD1BQ9P298 99 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 GNRH2O43555 120 aa8.26□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 ATP5LO75964 103 aa8.26□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.26□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 RNF183Q96D59 192 aa8.25□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 LINC00477Q96M19 166 aa8.23□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 C20orf78Q9BR46 151 aa8.23□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 E9PLD3 99 aa8.22□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.22□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 GAGE5Q13069 117 aa8.21□□□□□ -1.09
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE6Q13070 117 aa8.21□□□□□ -1.09
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C9orf3-214ENST00000473778 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 A6NDX4 124 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 IGLL5B9A064 214 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 OVOL1O14753 267 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 APOMO95445 188 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 MGPP08493 103 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 HLA-DRB4P13762 266 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.21□□□□□ -1.1
C9orf3-214ENST00000473778 CDIP1Q9H305 208 aa8.21□□□□□ -1.1
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