RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469602.1

SRRT-208, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-208ENST00000469602 C11orf52Q96A22 123 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 PTH2Q96A98 100 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.74□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 RS1O15537 224 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 LINC01559Q495D7 138 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 DNLZQ5SXM8 178 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 BAGE2Q86Y30 109 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 DERL1Q9BUN8 251 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 MLST8Q9BVC4 326 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 IL36BQ9NZH7 164 aa6.73□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 H3BVH4 76 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 PDE6DO43924 150 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 CIDEAO60543 219 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 BCL2P10415 239 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 ZNF575Q86XF7 245 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 UPK3BQ9BT76 320 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 VAX2Q9UIW0 290 aa6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SRRT-208ENST00000469602 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 K7EQD1 137 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 GYPEP15421 78 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 CENPWQ5EE01 88 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 Q9H8V8 135 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.71□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PKD1P98161 4303 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 A8MWV9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RTL8CO15255 209 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SRIP30626 198 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 GNG4P50150 75 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 BLOC1S1P78537 153 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PRR27Q6MZM9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SYT8Q8NBV8 401 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.7□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RAB19A4D1S5 217 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 IGLV2-8P01709 118 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SMIM12Q96EX1 92 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PARLQ9H300 379 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 MED9Q9NWA0 146 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PKHD1P08F94 4074 aa6.69□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 M0R381 172 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 NXPH4O95158 308 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 CXCL1P09341 107 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 MED14OSP0DP75 135 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RHOHQ15669 191 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TTC32Q5I0X7 151 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 ZFP82Q8N141 532 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.68□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 A0A1W2PPQ1 181 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 RHODO00212 210 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SIVA1O15304 175 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 Q6ZSN1 163 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 C6orf223Q8N319 242 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SFRP2Q96HF1 295 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 JPT2Q9H910 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TMEM250H0YL14 139 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 OR5AL1P0C617 328 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 TIRAPP58753 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 BIN3Q9NQY0 253 aa6.66□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 A0A087WWL8 130 aa6.65□□□□□ -1.34
SRRT-208ENST00000469602 SNAI2O43623 268 aa6.65□□□□□ -1.34
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