RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 CIDEAO60543 219 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 DNLZQ5SXM8 178 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 UPK3BQ9BT76 320 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 MLST8Q9BVC4 326 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 IL36BQ9NZH7 164 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 K7EQD1 137 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 RTL8CO15255 209 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 GYPEP15421 78 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNA1P01562 189 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01559Q495D7 138 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf52Q96A22 123 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 NACAE9PAV3 2078 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 SRIP30626 198 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BVH4 76 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 DERL1Q9BUN8 251 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MWV9 139 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE6DO43924 150 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 VAX2Q9UIW0 290 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.51□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL2P10415 239 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 BLOC1S1P78537 153 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR27Q6MZM9 219 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SYT8Q8NBV8 401 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 MED9Q9NWA0 146 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB19A4D1S5 217 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PARLQ9H300 379 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 JPT2Q9H910 190 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 NXPH4O95158 308 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SIVA1O15304 175 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPWQ5EE01 88 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZSN1 163 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 C6orf223Q8N319 242 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV2-8P01709 118 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOHQ15669 191 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC32Q5I0X7 151 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPQ1 181 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R381 172 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 GNG4P50150 75 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 CXCL1P09341 107 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 MED14OSP0DP75 135 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP82Q8N141 532 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SFRP2Q96HF1 295 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GVY2 172 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM12Q96EX1 92 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WWL8 130 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 RHODO00212 210 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYGDP07320 174 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAI2O43623 268 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 TIRAPP58753 221 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-204ENST00000416021 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms