RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 F2Z2F3 143 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 PHOX2AO14813 284 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 HBBP68871 147 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 TDRG1Q3Y452 100 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 BORCS7Q96B45 105 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 KCNS1Q96KK3 526 aa21.36■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
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ECHS1-201ENST00000368547 DNLZQ5SXM8 178 aa21.35■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 LYZL1Q6UWQ5 148 aa21.35■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 CNFNQ9BYD5 112 aa21.35■■□□□ 1.01
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ECHS1-201ENST00000368547 FAM159AQ6UWV7 190 aa21.34■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM136Q6ZRR5 245 aa21.34■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa21.34■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 HLA-DQA1P01909 254 aa21.33■■□□□ 1.01
ECHS1-201ENST00000368547 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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ECHS1-201ENST00000368547 LINC00467Q9BRT7 94 aa21.33■■□□□ 1
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ECHS1-201ENST00000368547 ARMS2P0C7Q2 107 aa21.32■■□□□ 1
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ECHS1-201ENST00000368547 ASIPP42127 132 aa21.29■■□□□ 1
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ECHS1-201ENST00000368547 RAB4BP61018 213 aa21.27■■□□□ 1
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ECHS1-201ENST00000368547 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa21.26■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 ZFP82Q8N141 532 aa21.26■□□□□ 0.99
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ECHS1-201ENST00000368547 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2BHQ93079 126 aa21.23■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2BNQ99877 126 aa21.23■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 HIST1H2BMQ99879 126 aa21.23■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 APCSP02743 223 aa21.22■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 NTF3P20783 257 aa21.22■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 MDFICQ9P1T7 246 aa21.22■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 PLAC8L1A1L4L8 177 aa21.22■□□□□ 0.99
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ECHS1-201ENST00000368547 C11orf72Q8NBR9 251 aa21.22■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 TWIST1Q15672 202 aa21.21■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa21.21■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 U3KQK5 164 aa21.21■□□□□ 0.99
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa21.2■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0J9YWU9 116 aa21.2■□□□□ 0.98
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ECHS1-201ENST00000368547 MUC21A0A140T8X8 626 aa21.17■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 SPANXN1Q5VSR9 72 aa21.17■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 C9orf85Q96MD7 179 aa21.17■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM191AQ9H0A3 160 aa21.17■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 NXPH4O95158 308 aa21.16■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 S100A6P06703 90 aa21.15■□□□□ 0.98
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ECHS1-201ENST00000368547 IL17DQ8TAD2 202 aa21.15■□□□□ 0.98
ECHS1-201ENST00000368547 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
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ECHS1-201ENST00000368547 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
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