RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 GRIFINA4D1Z8 144 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 H3BVH4 76 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 RTL8CO15255 209 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf52Q96A22 123 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 MLST8Q9BVC4 326 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.3□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 TEX46H3BTG2 121 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 RS1O15537 224 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 LINC01559Q495D7 138 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 BAGE2Q86Y30 109 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 UPK3BQ9BT76 320 aa10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 K7EQD1 137 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 GYPEP15421 78 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 DNLZQ5SXM8 178 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 PTH2Q96A98 100 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 IL36BQ9NZH7 164 aa10.28□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 BCL2P10415 239 aa10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 Q9H8V8 135 aa10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 JPT2Q9H910 190 aa10.27□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 IFNA1P01562 189 aa10.26□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PRR27Q6MZM9 219 aa10.26□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC17Q9BRA2 123 aa10.26□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PARLQ9H300 379 aa10.26□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PKD1P98161 4303 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV2-8P01709 118 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 SRIP30626 198 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 CENPWQ5EE01 88 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A29Q8N8R3 303 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 SCRT2Q9NQ03 307 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.25□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 RAB19A4D1S5 217 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 NXPH4O95158 308 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 VAX2Q9UIW0 290 aa10.24□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 A8MWV9 139 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PDE6DO43924 150 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 UFSP1Q6NVU6 142 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZSN1 163 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 MED9Q9NWA0 146 aa10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GVY2 172 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 M0R381 172 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 CIDEAO60543 219 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 MGST1P10620 155 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 BLOC1S1P78537 153 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 RHOHQ15669 191 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 SYT8Q8NBV8 401 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa10.22□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL1P09341 107 aa10.21□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 GNG4P50150 75 aa10.21□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.21□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf223Q8N319 242 aa10.21□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.21□□□□□ -0.77
CSAG1-201ENST00000361211 PKHD1P08F94 4074 aa10.21□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WWL8 130 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 SIVA1O15304 175 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 MED14OSP0DP75 135 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 TTC32Q5I0X7 151 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP82Q8N141 532 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 SFRP2Q96HF1 295 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 Q9UF83 564 aa10.2□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 SNAI2O43623 268 aa10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 CRYGDP07320 174 aa10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 SOHLH1Q5JUK2 328 aa10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.18□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.18□□□□□ -0.78
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPQ1 181 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.6 ms