RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PRX2 142 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 TOMM6Q96B49 74 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-69P01742 117 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 EFNA2O43921 213 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.53□□□□□ -1.36
PKHD1-201ENST00000340994 HIVEP2P31629 2446 aa6.53□□□□□ -1.36
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PKHD1-201ENST00000340994 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.53□□□□□ -1.36
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PKHD1-201ENST00000340994 RNF183Q96D59 192 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 K7ERS5 55 aa6.52□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 LRRK2Q5S007 2527 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 PRR20DP86480 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 PRR20BP86481 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 PRR20AP86496 221 aa6.52□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 METRNQ9UJH8 293 aa6.52□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 UBE2E1P51965 193 aa6.52□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 DAD1P61803 113 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.52□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 COL4A1P02462 1669 aa6.51□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 TRBV12-3P01733 135 aa6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MED14OSP0DP75 135 aa6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.51□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 ODF1Q14990 250 aa6.51□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 SAA4P35542 130 aa6.5□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.5□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 H3BUX3 64 aa6.5□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.49□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 MIAQ16674 131 aa6.49□□□□□ -1.37
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PKHD1-201ENST00000340994 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 Q8NFD4 153 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 GTSF1Q8WW33 167 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 BUB3O43684 328 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 GP9P14770 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 RBX1P62877 108 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 TCL1BO95988 128 aa6.48□□□□□ -1.37
PKHD1-201ENST00000340994 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.48□□□□□ -1.37
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