RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 ETDBQ3ZM63 59 aa13.08□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS29PA6NIE9 313 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 EMP1P54849 157 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00477Q96M19 166 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRADC1Q9BSG0 188 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SRD5A1P18405 259 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 RRN3P1Q2M238 152 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.06□□□□□ -0.32
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PDE4A-201ENST00000293683 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.06□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 FAM223BA6NKX1 122 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 EDN2P20800 178 aa13.05□□□□□ -0.32
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PDE4A-201ENST00000293683 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf78Q9BR46 151 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 JPT2Q9H910 190 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 F8W1H4 67 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SFTA2Q6UW10 78 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SLC25A16P16260 332 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 INSL3P51460 131 aa13.04□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF815PA8K554 130 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PRO0461Q9UI25 63 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GWB2 263 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 OVOL1O14753 267 aa13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 CRYGDP07320 174 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 AZU1P20160 251 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 SCGB2A2Q13296 93 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 Q6ZS46 218 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 ITPR1Q14643 2758 aa13.02□□□□□ -0.32
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFA4O00483 81 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 TSHBP01222 138 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SPG11Q96JI7 2443 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE13Q4V321 117 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 RPL39P62891 51 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 C11orf86A6NJI1 115 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 COX6B1P14854 86 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC00315P59091 139 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 CSMD2Q7Z408 3487 aa13□□□□□ -0.33
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PDE4A-201ENST00000293683 C19orf84I3L1E1 186 aa13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa13□□□□□ -0.33
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PDE4A-201ENST00000293683 PF4V1P10720 104 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 BLCAPP62952 87 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 22
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PDE4A-201ENST00000293683 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01619G3V211 115 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV1-69P01742 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LINC01549A6NIU2 74 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-39P01824 125 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 ATP6V0BQ99437 205 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 LY6DQ14210 128 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 APRG1Q8IVJ8 170 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 SIGMAR1Q99720 223 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 H3BUX3 64 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 UCNP55089 124 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4A-201ENST00000293683 APOMO95445 188 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 MED14OSP0DP75 135 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 ZFP2Q6ZN57 461 aa12.96□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 IGIPA6NJ69 53 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 F5H697 171 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 NXPH4O95158 308 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 TSPAN13O95857 204 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 UBE2D1P51668 147 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 POM121L12Q8N7R1 296 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4A-201ENST00000293683 SORL1Q92673 2214 aa12.94□□□□□ -0.34
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