RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 C18orf15Q96N68 181 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 C7orf71A4D174 169 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 NXPH4O95158 308 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SLURP1P55000 103 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.7□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 AGRNO00468 2067 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TCAPO15273 167 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TMEM86BQ8N661 226 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 STPG4Q8N801 248 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 CD5LO43866 347 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.69□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 AP1S3Q96PC3 154 aa14.68□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 IGKV3-20P01619 116 aa14.68□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 LAGE3Q14657 143 aa14.68□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 DPF1Q92782 380 aa14.68□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TEX29Q8N6K0 151 aa14.67□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 RASL10AQ92737 203 aa14.67□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SMIM2Q9BVW6 85 aa14.67□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 LINC01619G3V211 115 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 CD7P09564 240 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 COX8AP10176 69 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 OR11H1Q8NG94 326 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 PDZD2O15018 2839 aa14.66□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 MGPP08493 103 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 CDKN1BP46527 198 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 DKK2Q9UBU2 259 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SORL1Q92673 2214 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SMIM17P0DL12 118 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 C20orf78Q9BR46 151 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RTKN-201ENST00000233330 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 PLA2G2AP14555 144 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 Q6ZSV7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ODF1Q14990 250 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 DUX3Q96PT4 197 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 LINC00315P59091 139 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 PEMTQ9UBM1 199 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ATP5LO75964 103 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 PRSS1P07477 247 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 AMTNQ6UX39 209 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ZMAT4Q9H898 229 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 C9orf85Q96MD7 179 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 G0S2P27469 103 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 MPV17L2Q567V2 206 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 J3QKU1 62 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 NUDT3O95989 172 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 FGF6P10767 208 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 FOXC2Q99958 501 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 JPT2Q9H910 190 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 CUBNO60494 3623 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R17O96001 155 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ORMDL2Q53FV1 153 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 Q8N1Y9 231 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 MDFICQ9P1T7 246 aa14.6□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 K7EMI3 77 aa14.59□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.59□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.59□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 NF1P21359 2839 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 TMEM61Q8N0U2 210 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 ESM1Q9NQ30 184 aa14.58□□□□□ -0.07
RTKN-201ENST00000233330 DEFB131AP59861 70 aa14.58□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 KNCNA6PVL3 124 aa14.57□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 TCTAP57738 103 aa14.57□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 BOD1L2Q8IYS8 172 aa14.57□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.57□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 ITPR2Q14571 2701 aa14.56□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 A0A087WWL8 130 aa14.56□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 IGKCP01834 107 aa14.56□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa14.56□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.56□□□□□ -0.08
RTKN-201ENST00000233330 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113 ms