RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21974F6W3F3 119 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nxph4G3X9N5 304 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gata2O09100 480 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifna4P07351 186 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxa1P09022 331 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NdnP25233 325 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RbpjP31266 526 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd27P41272 250 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SlaQ60898 281 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifna12Q80SS5 189 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AdtrpQ8C138 230 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr435Q8VFS3 313 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr19Q9JHB2 309 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav17A0A075B655 113 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctxnd2A0A1B0GQX3 59 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Samt1A2BED8 237 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15140A2BEE3 237 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21732J3QM79 361 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21921J3QNB5 361 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde6dO55057 150 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GzmfP08883 248 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxa5P09021 270 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dlx6P70397 175 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1371Q7TQT7 311 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spaca3Q9D9X8 221 aa11.05□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nsun4C4P6S0 806 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irf2bp2E9Q1P8 570 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1154L7MU57 310 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rom1P32958 351 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nkx3-1P97436 237 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc25a31Q3V132 320 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adora3Q61618 319 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scgb2b24Q7M747 112 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr976Q8VF15 326 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr476Q8VGI4 310 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Glrx2Q923X4 156 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Actl6bQ99MR0 426 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem190Q9D2E9 166 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps11Q9DCA2 191 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc35d1A2AKQ0 355 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20481G3UXK4 153 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01789 122 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssty1P13675 232 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psg22Q810J1 475 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Shisal2bQ9D1Y9 158 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tln2Q71LX4 2375 aa11.04□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Esp6A8R0U0 136 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spint5J3KMK8 105 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1331K7N684 317 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1333Q7TQV7 317 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zg16Q8K0C5 167 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr968Q8VFN4 314 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cma2Q91VB1 246 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pth2Q91W27 100 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uqcc1Q9CWU6 295 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Btbd17Q9DB72 478 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 B1ARW8 110 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lce6aD3YV94 81 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20422E9PUR3 255 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr177E9Q7W1 309 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01674 108 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rph3alQ768S4 302 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Msrb3Q8BU85 253 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cisd1Q91WS0 108 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Derl1Q99J56 251 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CnmdQ9Z1F6 334 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spg11Q3UHA3 2430 aa11.03□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr43Q7TRX1 313 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1030Q8VFL5 318 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1271Q8VG62 305 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdzd11Q9CZG9 140 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem239Q9DA47 151 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttc32Q9DAC7 148 aa11.02□□□□□ -0.64
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700003H04RikE9PXM2 192 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm4791J3QQ14 102 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ascl5M0QWB7 188 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LoxP28301 411 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pfn1P62962 140 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CenptQ3TJM4 515 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam78bQ8BQN5 261 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptrh2Q8R2Y8 181 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr124Q8VGW6 315 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930583I09RikQ9D2E3 102 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r46Q9EQ45 309 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp931A2AHM2 298 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr39E9PVX1 319 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdx1P18111 268 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RhobP62746 196 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms