Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9X8

Spaca3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spaca3Q9D9X8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Spaca3Q9D9X8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Spaca3Q9D9X8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Spaca3Q9D9X8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Spaca3Q9D9X8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spaca3Q9D9X8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Spaca3Q9D9X8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spaca3Q9D9X8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spaca3Q9D9X8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spaca3Q9D9X8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spaca3Q9D9X8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spaca3Q9D9X8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spaca3Q9D9X8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spaca3Q9D9X8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spaca3Q9D9X8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spaca3Q9D9X8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spaca3Q9D9X8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spaca3Q9D9X8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spaca3Q9D9X8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spaca3Q9D9X8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spaca3Q9D9X8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spaca3Q9D9X8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Spaca3Q9D9X8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spaca3Q9D9X8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spaca3Q9D9X8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spaca3Q9D9X8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spaca3Q9D9X8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spaca3Q9D9X8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spaca3Q9D9X8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spaca3Q9D9X8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spaca3Q9D9X8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spaca3Q9D9X8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spaca3Q9D9X8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spaca3Q9D9X8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spaca3Q9D9X8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spaca3Q9D9X8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spaca3Q9D9X8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spaca3Q9D9X8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spaca3Q9D9X8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spaca3Q9D9X8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Spaca3Q9D9X8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spaca3Q9D9X8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spaca3Q9D9X8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spaca3Q9D9X8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spaca3Q9D9X8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spaca3Q9D9X8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spaca3Q9D9X8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spaca3Q9D9X8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spaca3Q9D9X8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spaca3Q9D9X8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Spaca3Q9D9X8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spaca3Q9D9X8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spaca3Q9D9X8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spaca3Q9D9X8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spaca3Q9D9X8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spaca3Q9D9X8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spaca3Q9D9X8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Spaca3Q9D9X8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spaca3Q9D9X8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spaca3Q9D9X8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spaca3Q9D9X8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spaca3Q9D9X8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spaca3Q9D9X8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spaca3Q9D9X8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spaca3Q9D9X8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spaca3Q9D9X8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spaca3Q9D9X8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spaca3Q9D9X8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spaca3Q9D9X8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spaca3Q9D9X8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spaca3Q9D9X8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spaca3Q9D9X8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spaca3Q9D9X8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spaca3Q9D9X8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spaca3Q9D9X8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Spaca3Q9D9X8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spaca3Q9D9X8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spaca3Q9D9X8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spaca3Q9D9X8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spaca3Q9D9X8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spaca3Q9D9X8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spaca3Q9D9X8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spaca3Q9D9X8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spaca3Q9D9X8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spaca3Q9D9X8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spaca3Q9D9X8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Spaca3Q9D9X8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spaca3Q9D9X8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spaca3Q9D9X8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spaca3Q9D9X8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spaca3Q9D9X8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spaca3Q9D9X8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spaca3Q9D9X8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spaca3Q9D9X8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms