Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gata2O09100 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gata2O09100 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gata2O09100 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gata2O09100 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gata2O09100 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gata2O09100 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gata2O09100 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gata2O09100 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gata2O09100 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gata2O09100 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gata2O09100 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gata2O09100 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gata2O09100 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata2O09100 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata2O09100 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gata2O09100 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gata2O09100 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gata2O09100 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gata2O09100 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gata2O09100 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gata2O09100 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gata2O09100 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gata2O09100 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gata2O09100 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gata2O09100 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gata2O09100 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata2O09100 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gata2O09100 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata2O09100 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gata2O09100 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gata2O09100 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gata2O09100 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gata2O09100 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gata2O09100 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gata2O09100 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gata2O09100 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gata2O09100 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gata2O09100 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gata2O09100 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata2O09100 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata2O09100 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata2O09100 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata2O09100 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata2O09100 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gata2O09100 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata2O09100 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gata2O09100 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gata2O09100 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gata2O09100 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gata2O09100 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gata2O09100 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata2O09100 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gata2O09100 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gata2O09100 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gata2O09100 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata2O09100 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gata2O09100 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gata2O09100 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gata2O09100 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gata2O09100 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gata2O09100 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gata2O09100 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gata2O09100 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gata2O09100 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gata2O09100 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gata2O09100 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gata2O09100 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gata2O09100 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gata2O09100 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gata2O09100 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata2O09100 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gata2O09100 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gata2O09100 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gata2O09100 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gata2O09100 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gata2O09100 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gata2O09100 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gata2O09100 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gata2O09100 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gata2O09100 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gata2O09100 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gata2O09100 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gata2O09100 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gata2O09100 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gata2O09100 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gata2O09100 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gata2O09100 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gata2O09100 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gata2O09100 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gata2O09100 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata2O09100 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gata2O09100 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gata2O09100 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata2O09100 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms