Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ifna12Q80SS5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ifna12Q80SS5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ifna12Q80SS5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ifna12Q80SS5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ifna12Q80SS5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ifna12Q80SS5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ifna12Q80SS5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ifna12Q80SS5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ifna12Q80SS5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ifna12Q80SS5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifna12Q80SS5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifna12Q80SS5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifna12Q80SS5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifna12Q80SS5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ifna12Q80SS5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ifna12Q80SS5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ifna12Q80SS5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ifna12Q80SS5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifna12Q80SS5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifna12Q80SS5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifna12Q80SS5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifna12Q80SS5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifna12Q80SS5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifna12Q80SS5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifna12Q80SS5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifna12Q80SS5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifna12Q80SS5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifna12Q80SS5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifna12Q80SS5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifna12Q80SS5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifna12Q80SS5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifna12Q80SS5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifna12Q80SS5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna12Q80SS5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifna12Q80SS5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifna12Q80SS5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifna12Q80SS5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ifna12Q80SS5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ifna12Q80SS5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ifna12Q80SS5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ifna12Q80SS5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifna12Q80SS5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ifna12Q80SS5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ifna12Q80SS5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ifna12Q80SS5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ifna12Q80SS5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ifna12Q80SS5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ifna12Q80SS5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ifna12Q80SS5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifna12Q80SS5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifna12Q80SS5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifna12Q80SS5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifna12Q80SS5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna12Q80SS5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna12Q80SS5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ifna12Q80SS5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifna12Q80SS5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifna12Q80SS5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifna12Q80SS5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifna12Q80SS5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ifna12Q80SS5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifna12Q80SS5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifna12Q80SS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ifna12Q80SS5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifna12Q80SS5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifna12Q80SS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifna12Q80SS5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ifna12Q80SS5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifna12Q80SS5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifna12Q80SS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifna12Q80SS5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifna12Q80SS5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifna12Q80SS5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifna12Q80SS5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifna12Q80SS5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifna12Q80SS5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifna12Q80SS5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifna12Q80SS5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifna12Q80SS5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifna12Q80SS5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifna12Q80SS5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifna12Q80SS5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifna12Q80SS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna12Q80SS5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifna12Q80SS5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifna12Q80SS5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms