RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PPV4	95 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	GPX1	P07203	203 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	SLA	Q13239	276 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	TMED6	Q8WW62	240 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		9.48	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	EPM2A	B3EWF7	344 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	GGTLC3	B5MD39	225 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	CRYBA4	P53673	196 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	ERVFC1-1	P60608	527 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	TEX261	Q6UWH6	196 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468		Q6ZQT7	251 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	SLC51B	Q86UW2	128 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF492	Q9P255	531 aa		9.47	□□□□□ -0.89
MUC1-222	ENST00000610468	UMAD1	C9J7I0	102 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	DIRC3	C9JPN6	131 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	CXorf1	O96002	111 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-53	P01767	116 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	IFITM2	Q01629	132 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FHL2	Q14192	279 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	NFE4	Q86UQ8	179 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	OTOR	Q9NRC9	128 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		9.46	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FAT1	Q14517	4588 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		K7EP13	123 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	EREG	O14944	169 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SULT1A2	P50226	295 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF138	P52744	262 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	XG	P55808	180 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TVP23C	Q96ET8	276 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	C8orf49	Q96NF6	230 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		9.45	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		A0A087WTM6	91 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		A0A1W2PRE2	83 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	RBAKDN	A6NC62	111 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	PGP	A6NDG6	321 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV2-11	P01706	119 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	RAB14	P61106	215 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	CCL20	P78556	96 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF415	Q09FC8	603 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		Q8TAT8	98 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		9.44	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FAM74A7	A6NL05	159 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	GNG5	P63218	68 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		9.43	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		K7EQD1	137 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP10-1	P60331	282 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	RASL10A	Q92737	203 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		9.42	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TCRA	P04437	139 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SRI	P30626	198 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468		Q6AWC8	147 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF479	Q96JC4	524 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	EPDR1	Q9UM22	224 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		9.41	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ORM1	P02763	201 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	RAB5C	P51148	216 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TDRG1	Q3Y452	100 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	CLLU1	Q5K131	121 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	MUC21	Q5SSG8	566 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00479	Q96M42	142 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SPX	Q9BT56	116 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		9.4	□□□□□ -0.9
MUC1-222	ENST00000610468	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		9.39	□□□□□ -0.91
MUC1-222	ENST00000610468	SFTA3	P0C7M3	94 aa		9.39	□□□□□ -0.91

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