RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590977.5

EFTUD2-219, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 2,422 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-219ENST00000590977 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ECSCRQ19T08 205 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 Q6AWC8 147 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 RNF125Q96EQ8 232 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 B5MCH6 92 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 G3V318 75 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 H3BRN7 92 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHV1-69P01742 117 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 COL8A1P27658 744 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LINC01559Q495D7 138 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 PRELID3AQ96N28 172 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 EVI2AP22794 236 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CLEC3BP05452 202 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CTSGP08311 255 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TEX29Q8N6K0 151 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ZANQ9Y493 2812 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 PTPN13Q12923 2485 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LINC01619G3V211 115 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TCRAP04437 139 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TCTAP57738 103 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 AMTNQ6UX39 209 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM262E9PQX1 116 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGHG4P01861 327 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 SRD5A1P18405 259 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 FHL3Q13643 280 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 OTORQ9NRC9 128 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 DKK2Q9UBU2 259 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE12JA6NER3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE7O76087 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 AVPP01185 164 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE12FP0CL80 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE12GP0CL81 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE12IP0CL82 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GAGE4Q13068 117 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 C15orf32Q32M92 178 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 Q86TA4 180 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 NFE4Q86UQ8 179 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ORMDL3Q8N138 153 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ASCL2Q99929 193 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGLV2-11P01706 119 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 MSMBP08118 114 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CITED1Q99966 193 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LINC01546A6NGU7 62 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 D6R8Y8 96 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 IGKCP01834 107 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ARL3P36405 182 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 ODF1Q14990 250 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 RHODO00212 210 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 BRI3O95415 125 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 LY6EQ16553 131 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 KLK9Q2XQG4 91 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 TEN1Q86WV5 123 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CCDC140Q96MF4 163 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 M0R3E3 92 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CR1P17927 2039 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-219ENST00000590977 CHD6Q8TD26 2715 aa7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 490.4 ms