RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	PARL	Q9H300	379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	LCE6A	A0A183	80 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	KNCN	A6PVL3	124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	PRSS46	E5RG02	174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	ISLR	O14498	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	IFNA5	P01569	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00869	P0C866	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	ESD	P10768	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	ORM2	P19652	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	CTRL	P40313	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	KRTDAP	P60985	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	HBG1	P69891	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	HBG2	P69892	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	RAB31	Q13636	194 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	BAGE2	Q86Y30	109 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	OR11H2	Q8NH07	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	OR10J4	P0C629	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	HLA-DRB4	P13762	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	CRISP2	P16562	243 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TSPO	P30536	169 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	BAX	Q07812	192 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	FAM78B	Q5VT40	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	C16orf92	Q96LL3	132 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF253	O75346	499 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	MIF	P14174	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	BORCS7	Q96B45	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	AP1S3	Q96PC3	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	ATP5S	Q99766	215 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	IGSF23	A1L1A6	192 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM250	H0YL14	139 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873		H3BMM0	161 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873		H3BRN7	92 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	COX7A2P2	O60397	106 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	SERF1A	O75920	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	PLP1	P60201	277 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	LCN15	Q6UWW0	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZVH6	145 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	RSG1	Q9BU20	258 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	GAGE10	A6NGK3	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	C11orf94	C9JXX5	98 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	SOCS3	O14543	225 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	NUPR1	O60356	82 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	CST7	O76096	145 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV3-20	P01619	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM17	P0DL12	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	PAX9	P55771	341 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	CKS1B	P61024	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ACER3-213	ENST00000533873	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61

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