RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00479	Q96M42	142 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf49	Q96NF6	230 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	APLN	Q9ULZ1	77 aa		10.35	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	CCL20	P78556	96 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	MUC21	Q5SSG8	566 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		10.34	□□□□□ -0.75
PTPA-222	ENST00000445241	PDE6D	O43924	150 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZTI0	123 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE12B	A1L429	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE7	O76087	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	TYMS	P04818	313 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE12F	P0CL80	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE12G	P0CL81	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GAGE12I	P0CL82	117 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	BCL2	P10415	239 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	RASL10A	Q92737	203 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241		H3BNG1	76 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241		M0R2P5	195 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	HTN3	P15516	51 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	PTH2	Q96A98	100 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	SMIM12	Q96EX1	92 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241		F5H768	121 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241		P0DMU3	169 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	FAM231A	P0DMU4	169 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	FAM231C	P0DMU5	169 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	MLST8	Q9BVC4	326 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	GNRH2	O43555	120 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	LY6G6C	O95867	125 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	SLA	Q13239	276 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	BAGE2	Q86Y30	109 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	LYST	Q99698	3801 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	CIDEA	O60543	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf85	Q96MD7	179 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PTPA-222	ENST00000445241	SH2D1A	O60880	128 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	CRIP1	P50238	77 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	BIN3	Q9NQY0	253 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241		B4DEV8	164 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM250	H0YL14	139 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	ORM1	P02763	201 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL1	P09341	107 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	ASIP	P42127	132 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	RNF212	Q495C1	297 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	TEX261	Q6UWH6	196 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	IL36B	Q9NZH7	164 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	HOXA5	P20719	270 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	OR5I1	Q13606	314 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	DERL1	Q9BUN8	251 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	NACA	E9PAV3	2078 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	GNG4	P50150	75 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF876P	Q49A33	203 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	CENPW	Q5EE01	88 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	IFITM2	Q01629	132 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241		C9JCJ5	164 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	S100A1	P23297	94 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PTPA-222	ENST00000445241	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		10.21	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms