RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		I3L2K1	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		K7EIM0	57 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEDD	O75618	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	CXCL3	P19876	107 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RND2	P52198	227 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HBG1	P69891	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HBG2	P69892	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKR1C1	Q04828	323 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL15RA	Q13261	267 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNC	P24821	2201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		A6NDN8	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BQ15	152 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OVOL1	O14753	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFB4	O95168	129 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPX1	P07203	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0U1RQV1	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	BMPR1B	O00238	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	BCL2L11	O43521	198 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	CST7	O76096	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GALR1	P47211	349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYNJ2BP	P57105	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		H0YIZ8	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALS9	O00182	355 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA4	O00483	81 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTSG	P08311	255 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66

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