RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 VCX2Q9H322 139 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.68□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 GPHB5Q86YW7 130 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 C3orf56Q8N813 242 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 MRAP2Q96G30 205 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 ATP6V0BQ99437 205 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 NUPR1O60356 82 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 IGHG4P01861 327 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.67□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 VCYO14598 125 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 COTL1Q14019 142 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 VWC2LB2RUY7 222 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 K7EMT4 169 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 C20orf173Q96LM9 149 aa7.66□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM89A2RUT3 159 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB130BP0DP73 79 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB130AP0DP74 79 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 ERASQ7Z444 233 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 Q8N8P6 123 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 CD5LO43866 347 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 AZU1P20160 251 aa7.65□□□□□ -1.18
TTPAL-202ENST00000372904 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.65□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PLXNB1O43157 2135 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PRSS2P07478 247 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 LINC01559Q495D7 138 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF702PQ9H963 129 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PAX2Q02962 417 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.64□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TNCP24821 2201 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 A6NJY4 79 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 COL6A3P12111 3177 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE12BA1L429 117 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE7O76087 117 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE12FP0CL80 117 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE12GP0CL81 117 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE12IP0CL82 117 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM86BQ8N661 226 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 STPG4Q8N801 248 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 INAFM1C9JVW0 142 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 H3BRM9 83 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 SMIM13P0DJ93 91 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 MYCNOSP40205 109 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 42
TTPAL-202ENST00000372904 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 PSMB8P28062 276 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 MAJINQ3KP22 176 aa7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE12JA6NER3 117 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE1Q13065 139 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE4Q13068 117 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE5Q13069 117 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 GAGE13Q4V321 117 aa7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms