RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0J9YY99 117 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 GCGP01275 180 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 TYMSP04818 313 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 AKAP14Q86UN6 197 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 C18orf15Q96N68 181 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.43□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 PAGE4O60829 102 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-53P01767 116 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 CST9LP1Q5W188 147 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 Q86TA4 180 aa10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1B0GVG6 124 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SMUG1Q53HV7 270 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 HIST1H2BAQ96A08 127 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SDF2L1Q9HCN8 221 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 NACAE9PAV3 2078 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 MUC4Q99102 2169 aa10.41□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 PFN1P07737 140 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 PPT1P50897 306 aa10.4□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP69Q49AA0 526 aa10.4□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 SPXQ9BT56 116 aa10.4□□□□□ -0.74
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SFTA3P0C7M3 94 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 RNF212Q495C1 297 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 KCNS1Q96KK3 526 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.39□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 M0R2N4 97 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1C3P42330 323 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 CCL20P78556 96 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SLC51BQ86UW2 128 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 RASL10AQ92737 203 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.38□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1A2P50226 295 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 CRIP1P50238 77 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2G1P62253 170 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 FHL2Q14192 279 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 FMC1Q96HJ9 113 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF479Q96JC4 524 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.37□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 A0A096LPF7 62 aa10.36□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 H3BNG1 76 aa10.36□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 M0R2P5 195 aa10.36□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 RAB5CP51148 216 aa10.36□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf85Q96MD7 179 aa10.36□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 LTAP01374 205 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 COX8CQ7Z4L0 72 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 GNG13Q9P2W3 67 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP30Q9Y2G7 519 aa10.35□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV4A0A0B4J268 109 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 PAX4O43316 350 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 SH2D1AO60880 128 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 CRYBA4P53673 196 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 CCL18P55774 89 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZR54 194 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 PRO0255Q9UI72 69 aa10.34□□□□□ -0.75
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 C9JCJ5 164 aa10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ESRGQ1W209 222 aa10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 MANBALQ9NQG1 85 aa10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.33□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 PGPEP1LA6NFU8 196 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 B4DEV8 164 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 M0R036 132 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ORM1P02763 201 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF674Q2M3X9 581 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 OR4C5Q8NGB2 326 aa10.32□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 KRBOX1C9JBD0 128 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ASIPP42127 132 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 SLAQ13239 276 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF876PQ49A33 203 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 FAM162BQ5T6X4 162 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF575Q86XF7 245 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 DERL1Q9BUN8 251 aa10.31□□□□□ -0.76
CSAG1-201ENST00000361211 ICOSQ9Y6W8 199 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.6 ms