RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 J3QQQ9 107 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 GHRHP01286 108 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 C17orf77Q96MU5 243 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 RNF5Q99942 180 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 IGHV3-53P01767 116 aa12.35□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 A0A087WX48 190 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 TRACP01848 142 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.34□□□□□ -0.43
KCNS1-201ENST00000306117 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 SOCS3O14543 225 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 PROP1O75360 226 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 NDUFB8O95169 186 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 CFC1BP0CG36 223 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 CFC1P0CG37 223 aa12.33□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 LTAP01374 205 aa12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 RBX1P62877 108 aa12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 STHQ8IWL8 128 aa12.32□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TECTAO75443 2155 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 PTPRSQ13332 1948 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 A0A1W2PRX2 142 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 VWC2LB2RUY7 222 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TEN1Q86WV5 123 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa12.31□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 HAMPP81172 84 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM126AQ9H061 195 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 HCFC1P51610 2035 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 SPRY2O43597 315 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 DPH3Q96FX2 82 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 PTH2Q96A98 100 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM141Q96I45 108 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 IGHG3P01860 377 aa12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 FOXI1Q12951 378 aa12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 C11orf44Q8N8P7 122 aa12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 C20orf78Q9BR46 151 aa12.29□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 OVOL2Q9BRP0 275 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 OVOL3O00110 214 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 PFN2P35080 140 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 C2orf70A6NJV1 201 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 GTSF1Q8WW33 167 aa12.28□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.27□□□□□ -0.44
KCNS1-201ENST00000306117 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 H3BRN7 92 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 MSMPQ1L6U9 139 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 K7EM74 188 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 E7EUB6 86 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 THBDP07204 575 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 MRAPQ8TCY5 172 aa12.27□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 SYNJ2BPP57105 145 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 THAP8Q8NA92 274 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 PRSS47A8MTI9 375 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 UBL5Q9BZL1 73 aa12.26□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 CR1LQ2VPA4 569 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 VCANP13611 3396 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 INSP01308 110 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF491Q8N8L2 437 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF415Q09FC8 603 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 POU2AF1Q16633 256 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 SPINK13Q1W4C9 94 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 UBE2E2Q96LR5 201 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 PEMTQ9UBM1 199 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 G3V318 75 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 RNF183Q96D59 192 aa12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.24□□□□□ -0.45
KCNS1-201ENST00000306117 A4D1N5 150 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.5 ms