RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.57	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6AWC8	147 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		Q9H8V8	135 aa		11.56	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A0J9YY99	117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		Q8TAT8	98 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		11.55	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	PGP	A6NDG6	321 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	SLA	Q13239	276 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	ESRG	Q1W209	222 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		Q6ZQT7	251 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	MED28	Q9H204	178 aa		11.54	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	SERF2	P84101	59 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.53	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
KIFC3-208	ENST00000561524		A0A096LPF7	62 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	MB	P02144	154 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB2A	P61019	212 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	SPX	Q9BT56	116 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.52	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	RASL10A	Q92737	203 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.51	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.5	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	PAX4	O43316	350 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.49	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	CRYBA4	P53673	196 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TNP2	Q05952	138 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	FHL2	Q14192	279 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.48	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.47	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524		K7EQM0	130 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	CXorf1	O96002	111 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	GCHFR	P30047	84 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524		Q5BKY6	102 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.46	□□□□□ -0.57
KIFC3-208	ENST00000561524	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	TCRA	P04437	139 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.45	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524		M0R2P5	195 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	SIVA1	O15304	175 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.44	□□□□□ -0.58
KIFC3-208	ENST00000561524	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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