RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 FAM74A1Q5RGS3 127 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 Q6ZTI0 123 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 RGS13O14921 159 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 ARPC5O15511 151 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TCL1AP56279 114 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 Q6AWC8 147 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 CYTL1Q9NRR1 136 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 KLF12Q9Y4X4 402 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 HOXA5P20719 270 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 ZNF726P1Q15940 193 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 RNF212Q495C1 297 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 SPINK4O60575 86 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 CXorf1O96002 111 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 TVP23CQ96ET8 276 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 C18orf15Q96N68 181 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-219ENST00000550655 GGTLC3B5MD39 225 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TAAR5O14804 337 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 MUC21Q5SSG8 566 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 C5orf17Q8NAS9 161 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TMEM167BQ9NRX6 74 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 NUDT3O95989 172 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 ARPC5LQ9BPX5 153 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 F6UZH7 168 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TCRAP04437 139 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 ZNF415Q09FC8 603 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 OR5I1Q13606 314 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 ZNF345Q14585 488 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 MUC4Q99102 2169 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 DNAH2Q9P225 4427 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 M0R2N4 97 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 Q6ZR54 194 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 KCNRGQ8N5I3 272 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 SGK494Q96LW2 274 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 MDFICQ9P1T7 246 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TRGV2A0A075B6R0 118 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 A0A0J9YY99 117 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 IGLV2-11P01706 119 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TDRG1Q3Y452 100 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 IQCF2Q8IXL9 164 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TREM1Q9NP99 234 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PRE2 83 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 HMSDA8MTL9 139 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 H3BNG1 76 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 FAM159AQ6UWV7 190 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TMEM183AQ8IXX5 376 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 ATG101Q9BSB4 218 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 EPDR1Q9UM22 224 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-219ENST00000550655 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 TRAV21A0A0B4J279 112 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 VSIG2Q96IQ7 327 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 C8orf49Q96NF6 230 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 NAGKQ9UJ70 344 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 PSG8Q9UQ74 426 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 FAT2Q9NYQ8 4349 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 TMEM75Q8N9X5 138 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 DNAH17Q9UFH2 4485 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 K7EQM0 130 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 RTL8CO15255 209 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 CCL18P55774 89 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 UBE2G2P60604 165 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 A0A0D9SG52 128 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 FAM74A7A6NL05 159 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 BCL2L11O43521 198 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 GNRH2O43555 120 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 IGHV3-53P01767 116 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-219ENST00000550655 TYMSP04818 313 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.9 ms