RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495663.1

RAB11FIP3-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RAB11FIP3, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.38□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ATG101Q9BSB4 218 aa7.38□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.38□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 EPDR1Q9UM22 224 aa7.38□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C11orf94C9JXX5 98 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 F6UZH7 168 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 M0R2Z0 102 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CT45A10P0DMU9 189 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TSPOP30536 169 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CDKN1BP46527 198 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF138P52744 262 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DEFB135Q30KP9 77 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 VGLL1Q99990 258 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF492Q9P255 531 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 XCL2Q9UBD3 114 aa7.37□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PEX7O00628 323 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BCL2P10415 239 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LEPP41159 167 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RNF183Q96D59 192 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RCHY1Q96PM5 261 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.36□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 COL7A1Q02388 2944 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SPRY2O43597 315 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 INSP01308 110 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NMBP08949 121 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RAB14P61106 215 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q8TAT8 98 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 VAX2Q9UIW0 290 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TGP01266 2768 aa7.35□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 J3KRW8 73 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PDE6DO43924 150 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GPX1P07203 203 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 CRISP2P16562 243 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 AKR1C3P42330 323 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 UBE2G1P62253 170 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IFITM2Q01629 132 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FMC1Q96HJ9 113 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SGK494Q96LW2 274 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RETNQ9HD89 108 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PSG8Q9UQ74 426 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.34□□□□□ -1.23
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GAGE12BA1L429 117 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KLLNB2CW77 178 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGLV2-11P01706 119 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 PRNTQ86SH4 94 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 OR11H2Q8NH07 326 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 LINC00479Q96M42 142 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 FAM210AQ96ND0 272 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 RARRES2Q99969 163 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TREM1Q9NP99 234 aa7.33□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C7orf71A4D174 169 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 BTN1A1Q13410 526 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 TOR2AQ5JU69 321 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 Q86TA4 180 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 C11orf52Q96A22 123 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 DKK2Q9UBU2 259 aa7.32□□□□□ -1.24
RAB11FIP3-211ENST00000495663 KLF12Q9Y4X4 402 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133 ms