RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493007.1

PITPNB-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein beta, humanhuman

TSL 3

Gene PITPNB, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNB-210ENST00000493007 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 Q8TAT8 98 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 STOML3Q8TAV4 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 DKK2Q9UBU2 259 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.5□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 A0A1W2PRE2 83 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 C11orf94C9JXX5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 GNG5P63218 68 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 BTN1A1Q13410 526 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TMED6Q8WW62 240 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 EPDR1Q9UM22 224 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TENM2Q9NT68 2774 aa6.49□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 GGTLC3B5MD39 225 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TCRAP04437 139 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 UBE2G2P60604 165 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 ZFP69Q49AA0 526 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 PRR9Q5T870 116 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 SLC51BQ86UW2 128 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 C16orf74Q96GX8 76 aa6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 RYR3Q15413 4870 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 FAM74A7A6NL05 159 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 LYRM9A8MSI8 78 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 K7EQM0 130 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 IFNA7P01567 189 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 DAD1P61803 113 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 SGK494Q96LW2 274 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PITPNB-210ENST00000493007 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 A0A1B0GV50 99 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 CBY3A6NI87 242 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 IGLL5B9A064 214 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 RGS13O14921 159 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 DEFB130BP0DP73 79 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 DEFB130AP0DP74 79 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 RAB5CP51148 216 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 Q6AWC8 147 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 Q6ZQT7 251 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 TVP23CQ96ET8 276 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 ATG101Q9BSB4 218 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 TREM1Q9NP99 234 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 PSG8Q9UQ74 426 aa6.46□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 LCE6AA0A183 80 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 SNURFLB1AK76 121 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 PAGE4O60829 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 IGLV2-11P01706 119 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 SULT1A2P50226 295 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 CST9LP1Q5W188 147 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 LINC00479Q96M42 142 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.45□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 F6UZH7 168 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 PEX7O00628 323 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 PPT1P50897 306 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 TCTAP57738 103 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 MUC21Q5SSG8 566 aa6.44□□□□□ -1.38
PITPNB-210ENST00000493007 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 271.8 ms