RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-DMBP28068 263 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 KLRD1Q13241 179 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.56□□□□□ -0.56
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TOP3B-206ENST00000436282 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 J3QR89 54 aa11.56□□□□□ -0.56
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TOP3B-206ENST00000436282 DTX2Q86UW9 622 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CFHR4Q92496 578 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF479Q96JC4 524 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM160Q9NX00 188 aa11.56□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC2Q14508 124 aa11.55□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 HES1Q14469 280 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 DPM3Q9P2X0 92 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE12HA6NDE8 117 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 KLRB1Q12918 225 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 DYNAPQ8N1N2 210 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.54□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 K7EMI3 77 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB2A1O75556 95 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 GOSR1O95249 250 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 C12orf74Q32Q52 190 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TTC9CQ8N5M4 171 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ARPC1AQ92747 370 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TIMD4Q96H15 378 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CSMD1Q96PZ7 3565 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-23P01764 117 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ERCC8Q13216 396 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS47A8MTI9 375 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 LAGE3Q14657 143 aa11.53□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CACNA1BQ00975 2339 aa11.52□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WX48 190 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CTSGP08311 255 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA25Q9BR10 227 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.52□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RBAKDNA6NC62 111 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 H3BMG7 143 aa11.51□□□□□ -0.57
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TOP3B-206ENST00000436282 PRAC2D3DTV9 90 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 TRGV3P03979 118 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 PLNP26678 52 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 HIST1H4GQ99525 98 aa11.51□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 UCNP55089 124 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RRN3P1Q2M238 152 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ETDBQ3ZM63 59 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01619G3V211 115 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.5□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 AGRNO00468 2067 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 GAGE13Q4V321 117 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GWB2 263 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.49□□□□□ -0.57
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TOP3B-206ENST00000436282 AMTNQ6UX39 209 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 PRO0461Q9UI25 63 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 LY6DQ14210 128 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RNF182Q8N6D2 247 aa11.48□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1B0GV72 72 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RAB9AP51151 201 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ODF3BA8MYP8 253 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 F8VRH5 84 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 EFNA4P52798 201 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.47□□□□□ -0.57
TOP3B-206ENST00000436282 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.47□□□□□ -0.57
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