RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 GFRALQ6UXV0 394 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MDFIQ99750 246 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM17BO60830 172 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 GP9P14770 177 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 Q9H3A6 140 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CTXN1P60606 82 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2D3P61077 147 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2D2P62837 147 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNG7P62955 275 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MLANAQ16655 118 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MDP1Q86V88 176 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPWQ5EE01 88 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SSMEM1Q8WWF3 244 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTBN2O15020 2390 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SMKR1H3BMG3 65 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 OR8A1Q8NGG7 326 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF747Q9BV97 191 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SPTA1P02549 2419 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PPYP01298 95 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IMUPQ9GZP8 106 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01619G3V211 115 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AL1P0C617 328 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 S1PR3Q99500 378 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC140Q96MF4 163 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TRGV9Q99603 122 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LHFPL6Q9Y693 200 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1AO00555 2505 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 RBMY1CP0DJD4 496 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JRQ6 117 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 WISP2O76076 250 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 NACAE9PAV3 2078 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 KISS1Q15726 138 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 ECSCRQ19T08 205 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N2B8 174 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM168AQ92567 244 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MGAQ8IWI9 3026 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 NPYP01303 97 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PCBD1P61457 104 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZPA2 131 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AS1Q8N127 324 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 KALRNO60229 2985 aa5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1-202ENST00000380828 TTC28Q96AY4 2481 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ATOX1O00244 68 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB134Q4QY38 66 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF525Q8N782 197 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF714Q96N38 554 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H4GQ99525 98 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF292O60281 2723 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM243Q9BU79 118 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL26Q9Y258 94 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CACNA1BQ00975 2339 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MU10 97 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R378 163 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 MFAP2P55001 183 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 SERP2Q8N6R1 65 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 DKK2Q9UBU2 259 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 R4GMQ9 66 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 PEX7O00628 323 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL8P80075 99 aa5.2□□□□□ -1.58
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