RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.89□□□□□ -0.35
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SH3BP4-201ENST00000344528 LEPROTO15243 131 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PRSS57Q6UWY2 283 aa12.85□□□□□ -0.35
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SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf16Q68DN1 1984 aa12.85□□□□□ -0.35
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SH3BP4-201ENST00000344528 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.82□□□□□ -0.36
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SH3BP4-201ENST00000344528 A0A087X0K7 114 aa12.82□□□□□ -0.36
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SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.8□□□□□ -0.36
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SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 WISP2O76076 250 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DRB4P13762 266 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NRGNQ92686 78 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa12.78□□□□□ -0.36
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SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
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SH3BP4-201ENST00000344528 FREM1Q5H8C1 2179 aa12.77□□□□□ -0.36
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