RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570063.5

RSRP1-222, Transcript of arginine and serine rich protein 1, human

TSL 5

Gene RSRP1, Length 1,821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSRP1-222	ENST00000570063	ZAN	Q9Y493	2812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RSRP1-222	ENST00000570063		A0A1B0GUT8	65 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RSRP1-222	ENST00000570063	GPX1	P07203	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RSRP1-222	ENST00000570063		Q6AWC8	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RSRP1-222	ENST00000570063	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RSRP1-222	ENST00000570063	CENPE	Q02224	2701 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM89	A2RUT3	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SOCS3	O14543	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	BMI1	P35226	326 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	RIG	Q13278	110 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063		A0A1B0GW15	77 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	CD33	P20138	364 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	APC	P25054	2843 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	CTRL	P40313	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	AMT	P48728	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF138	P52744	262 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063		K7EMT4	169 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	NIT1	Q86X76	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PMCH	P20382	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	PKIA	P61925	76 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	NRN1	Q9NPD7	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SMPX	Q9UHP9	88 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RSRP1-222	ENST00000570063	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	EDN2	P20800	178 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	FOXE3	Q13461	319 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063		Q8N976	141 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063		J3QKU1	62 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ORM1	P02763	201 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063		Q8N2B8	174 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063		M0QZ24	198 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	ELANE	P08246	267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	CNFN	Q9BYD5	112 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	PRR9	Q5T870	116 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RSRP1-222	ENST00000570063	TSTD3	H0UI37	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25

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