RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 PRR25Q96S07 402 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM4-205ENST00000550376 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 IQCJQ1A5X6 159 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 RCHY1Q96PM5 261 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 SH2D1AO60880 128 aa16■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 HLA-DQA1P01909 254 aa16■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 CT45A10P0DMU9 189 aa16■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 PSMB8P28062 276 aa16■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa16■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 H3BUA1 57 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 NDUFA4O00483 81 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 MT-ND6P03923 174 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 S100A7P31151 101 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 C16orf54Q6UWD8 224 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 A0A087X0K7 114 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GXF2 115 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 GLMPQ8WWB7 406 aa15.99■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 A0A0G2JLM5 398 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF253O75346 499 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 Q6ZQT7 251 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 C16orf92Q96LL3 132 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 C20orf173Q96LM9 149 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 CT83Q5H943 113 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.98■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 HBBP68871 147 aa15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 GPHB5Q86YW7 130 aa15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM18Q96B42 140 aa15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF702PQ9H963 129 aa15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 FAM162BQ5T6X4 162 aa15.96■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.96■□□□□ 0.15
PRDM4-205ENST00000550376 SORL1Q92673 2214 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 J3KRW8 73 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 BRI3O95415 125 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 PRSS57Q6UWY2 283 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ATP6V0BQ99437 205 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 SLC50A1Q9BRV3 221 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM189A5PLL7 270 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 A8MWP6 167 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 OR4B1Q8NGF8 309 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 GFRA4Q9GZZ7 299 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 M0QZ24 198 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 Q0VG73 95 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 COX19Q49B96 90 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF575Q86XF7 245 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 F6UB75 175 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ORM1P02763 201 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 FAM19A2Q8N3H0 131 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 C18orf32Q8TCD1 76 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 RASL11AQ6T310 242 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF738Q8NE65 137 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 PMCHP20382 165 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GUT8 65 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM213A2RRL7 107 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 RNF114Q9Y508 228 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1W2PS18 150 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 DEFB136Q30KP8 78 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 Q6ZWC4 215 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM4-205ENST00000550376 FAM231BA6NCW3 169 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 TFPI2P48307 235 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM78Q5T7P6 136 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 NDFIP1Q9BT67 221 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 C11orf21Q9P2W6 132 aa15.89■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 HAX1O00165 279 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 SYNJ2BPP57105 145 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 PRO1933Q9H354 126 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 SMPXQ9UHP9 88 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 NTF3P20783 257 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa15.88■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 A0A087WW49 117 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 SCGB1D1O95968 90 aa15.87■□□□□ 0.13
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF138P52744 262 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms