RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ODF1Q14990 250 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 LRBAP50851 2863 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 MED13LQ71F56 2210 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CHAC1Q9BUX1 264 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CCL21O00585 134 aa11.65□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 FCER1GP30273 86 aa11.65□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 BMI1P35226 326 aa11.65□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RNF185Q96GF1 192 aa11.65□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 GNG7O60262 68 aa11.65□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 LEPP41159 167 aa11.65□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.65□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CIDEAO60543 219 aa11.64□□□□□ -0.55
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TOP3B-206ENST00000436282 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 EVI2AP22794 236 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01559Q495D7 138 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 IGKCP01834 107 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CDSNQ15517 529 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 VGLL1Q99990 258 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ONECUT1Q9UBC0 465 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 RAXQ9Y2V3 346 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CNFNQ9BYD5 112 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 S4R3C0 116 aa11.63□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS1P07477 247 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 Q8TAT8 98 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TM2D2Q9BX73 214 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SMPXQ9UHP9 88 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 LY6LH3BQJ8 138 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 K7ERJ3 54 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF575Q86XF7 245 aa11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PRD5 423 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PRF3 423 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PRM7 423 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TNFRSF6BO95407 300 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-DRB4P13762 266 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 MFAP4P55083 255 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ATP5LO75964 103 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CEND1Q8N111 149 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SPTBN4Q9H254 2564 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TIMM23O14925 209 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NBR2O15453 112 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 DPM2O94777 84 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 GAS8-AS1O95177 125 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 FOXC2Q99958 501 aa11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZZEF1O43149 2961 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.555e-11■■□□□ 12.4
TOP3B-206ENST00000436282 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ORM1P02763 201 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SCGB1A1P11684 91 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 AKAP6Q13023 2319 aa11.6□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 DCHS2Q6V1P9 2916 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 FANCD2OSQ96PS1 177 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 E9PLD3 99 aa11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 F8W735 103 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
TOP3B-206ENST00000436282 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 IGHG4P01861 327 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM11P17152 192 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N8P6 123 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.58□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 F8W1H4 67 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFA3O95167 84 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NPBQ8NG41 125 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SIGMAR1Q99720 223 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 IGLL5B9A064 214 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 AZU1P20160 251 aa11.57□□□□□ -0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TAL2Q16559 108 aa11.57□□□□□ -0.56
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