RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 GATD1Q8NB37 220 aa12.03□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 SNAI2O43623 268 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 BUB3O43684 328 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.02□□□□□ -0.48
NISCH-202ENST00000420808 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PIEZO1Q92508 2521 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 FAM104BQ5XKR9 115 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ZANQ9Y493 2812 aa12.02□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 OR5AL1P0C617 328 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 TWIST1Q15672 202 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ZNF747Q9BV97 191 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 NPFFO15130 113 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 NPYP01303 97 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ORM1P02763 201 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 FA2HQ7L5A8 372 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PRELID3AQ96N28 172 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.01□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-39P01824 125 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 MPV17L2Q567V2 206 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 OR8A1Q8NGG7 326 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.493e-7■■■■□ 19.8
NISCH-202ENST00000420808 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 CENPEQ02224 2701 aa12□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 DEFB1P60022 68 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 C5orf56Q8N8D9 126 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 CSPG4Q6UVK1 2322 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 TRBV12-3P01733 135 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGLC6P0CF74 106 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.99□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 Q6AWC8 147 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 TMEM191AQ9H0A3 160 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 LINC01545Q5VT33 79 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 U3KQK5 164 aa11.98□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 SPRY2O43597 315 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PET117Q6UWS5 81 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 S100A7AQ86SG5 101 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 PIFOQ8TCI5 191 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 HSPB8Q9UJY1 196 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGF1P05019 195 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 EVI2AP22794 236 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ORMDL3Q8N138 153 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 OR10AG1Q8NH19 301 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 RNF185Q96GF1 192 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.97□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 A0A087X0K7 114 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 C20orf202A1L168 122 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 LY6EQ16553 131 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 ST20Q9HBF5 79 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 POLQO75417 2590 aa11.96□□□□□ -0.49
NISCH-202ENST00000420808 A0A1B0GW15 77 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 J3KRW8 73 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 TCF21O43680 179 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 CKS2P33552 79 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 PAX8Q06710 450 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 GAGE1Q13065 139 aa11.96□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 Q6ZS46 218 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 GOSR1O95249 250 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 NUDT3O95989 172 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 TRGV3P03979 118 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 C8orf86Q6ZUL3 223 aa11.95□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 CCL25O15444 150 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 CACNG7P62955 275 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 PRR9Q5T870 116 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 C18orf15Q96N68 181 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 PRORYQ9H606 182 aa11.94□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 BMI1P35226 326 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 C20orf173Q96LM9 149 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 CUBNO60494 3623 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 FBN2P35556 2912 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 IGHV3-11P01762 117 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.93□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.92□□□□□ -0.5
NISCH-202ENST00000420808 SCGB2A1O75556 95 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.3 ms