RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 BSNQ9UPA5 3926 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TCHHQ07283 1943 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 DENND4CQ5VZ89 1909 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CEP250Q9BV73 2442 aa3.27□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CCDC58Q4VC31 144 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PYDC2Q56P42 97 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 YPEL2Q96QA6 119 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 USP24Q9UPU5 2620 aa3.26□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 A0A1B0GVG6 124 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TMEM189A5PLL7 270 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 G3V3Q6 166 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 SHBGP04278 402 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FXYD2P54710 66 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 RHOGP84095 191 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 OR2T10Q8NGZ9 312 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 GINS4Q9BRT9 223 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CCL26Q9Y258 94 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 ARID1AO14497 2285 aa3.25□□□□□ -1.89
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MDM2-201ENST00000258148 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TCL1BO95988 128 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TMBIM6P55061 237 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 ARPP19P56211 112 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 Q5XG85 94 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 LRRC18Q8N456 261 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.25□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 EML5Q05BV3 1969 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 EPG5Q9HCE0 2579 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 A0A1B0GW64 132 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TNFSF15O95150 251 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 P0DMU3 169 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FAM231AP0DMU4 169 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FAM231CP0DMU5 169 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CRYGAP11844 174 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 SDC4P31431 198 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PRR9Q5T870 116 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CROCCP2Q86T23 111 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.24□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 F5P12259 2224 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 A0A0D9SG52 128 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 C9JAW5 83 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 J3QQQ9 107 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.893e-9■■□□□ 11.7
MDM2-201ENST00000258148 MORN2Q502X0 79 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 KHDC3LQ587J8 217 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FAM186AA6NE01 2351 aa3.23□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 BPTFQ12830 3046 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CHD6Q8TD26 2715 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PNN7 141 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 FAM92AA1XBS5 289 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 LYZL6O75951 148 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 NAPSAO96009 420 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 DBIP07108 87 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 HTR1AP08908 422 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 SCTP09683 121 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP10-3P60369 221 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 DYNLT1P63172 113 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TAF9Q16594 264 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 IGFL1Q6UW32 110 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 Q6ZQT0 140 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 AQP3Q92482 292 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PLXNB1O43157 2135 aa3.22□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 PCDH15Q96QU1 1955 aa3.21□□□□□ -1.89
MDM2-201ENST00000258148 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.21□□□□□ -1.9
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