RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640832.1

LINC01138-210, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1138, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01138, Length 1,709 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01138-210ENST00000640832 C3orf56Q8N813 242 aa6.97□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.97□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.97□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 JMJD1CQ15652 2540 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 C8orf87E5RJ46 101 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 H0YIZ8 118 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 PAX4O43316 350 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 FOXS1O43638 330 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 SCRG1O75711 98 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 PRH1P02810 166 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 COL8A2P25067 703 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 TMEM187Q14656 261 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 KIF26BQ2KJY2 2108 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 LINC01545Q5VT33 79 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 AMN1Q8IY45 258 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 OR52N5Q8NH56 324 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 LINC01600Q96MT4 127 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.96□□□□□ -1.29
LINC01138-210ENST00000640832 RTTNQ86VV8 2226 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 H3BT86 120 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 OR1I1O60431 355 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 COX6A1P12074 109 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 HLA-DOBP13765 273 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 MLANAQ16655 118 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 DEFB109BQ30KR1 87 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 PCP2Q8IVA1 136 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CEND1Q8N111 149 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 RNF182Q8N6D2 247 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ZNF799Q96GE5 643 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 U3KQE9 123 aa6.96□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 PLXNA2O75051 1894 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 NDUFB2O95178 105 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 APCSP02743 223 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CD55P08174 381 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 PTGDSP41222 190 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 C12orf73Q69YU5 71 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 Q6ZS49 121 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 NMNAT3Q96T66 252 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 FAM60AQ9NP50 221 aa6.95□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 K7ESM1 405 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 IGKCP01834 107 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CD7P09564 240 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 HIGD1BQ9P298 99 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ACANP16112 2415 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 C2orf70A6NJV1 201 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 IGLL5B9A064 214 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CFPP27918 469 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 DAD1P61803 113 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ERCC8Q13216 396 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ECSCRQ19T08 205 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 PDCD6O75340 191 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 GYPEP15421 78 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CXCL5P42830 114 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 CSN1S1P47710 185 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 NPC2P61916 151 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 Q6ZQT7 251 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 LIME1Q9H400 295 aa6.93□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 A0A1B0GXF2 115 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 ATOX1O00244 68 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 TCL1BO95988 128 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 OR5AS1Q8N127 324 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC01138-210ENST00000640832 RAB42Q8N4Z0 105 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.5 ms