RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		15.83	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		A0A087X0K7	114 aa		15.83	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	ZAN	Q9Y493	2812 aa		15.83	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	NUPR1	O60356	82 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	BAGE3	Q86Y29	109 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGHG4	P01861	327 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	HLA-DMB	P28068	263 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	CAMP	P49913	170 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	S100A12	P80511	92 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		Q0VG73	95 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	C8orf49	Q96NF6	230 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	KLK15	Q9H2R5	256 aa		15.82	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	FAM231B	A6NCW3	169 aa		15.81	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SLA	Q13239	276 aa		15.81	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	TRBV12-3	P01733	135 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	CT45A10	P0DMU9	189 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		U3KQE9	123 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		A0A1B0GXF2	115 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGHV3-11	P01762	117 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	GZMB	P10144	247 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	LCN12	Q6JVE5	192 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		15.8	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SERF1A	O75920	110 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	IGLV1-40	P01703	118 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SRI	P30626	198 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	CRIP1	P50238	77 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	HBB	P68871	147 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		15.79	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		F2Z2F3	143 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	VGLL1	Q99990	258 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		A0A0G2JLM5	398 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	NDUFA4	O00483	81 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	LINC00310	P59036	64 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	CFHR3	Q02985	330 aa		15.77	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	RNF182	Q8N6D2	247 aa		15.77	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850		Q96MF0	132 aa		15.77	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	PRR25	Q96S07	402 aa		15.77	■□□□□ 0.12
ME2-216	ENST00000639850	ESD	P10768	282 aa		15.77	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		15.77	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	OR5R1	Q8NH85	324 aa		15.77	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	FSHB	P01225	129 aa		15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	ZNF580	Q9UK33	172 aa		15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850		Q8TAT8	98 aa		15.76	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	APC	P25054	2843 aa		15.75	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	15.75	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		15.75	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850		A8MWP6	167 aa		15.74	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	PAFAH1B2	P68402	229 aa		15.74	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		15.74	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		15.74	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		15.74	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	PRAC2	D3DTV9	90 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	SH2D1A	O60880	128 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	CHD6	Q8TD26	2715 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	CREBBP	Q92793	2442 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	GLMP	Q8WWB7	406 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		15.73	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	RBAKDN	A6NC62	111 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	ERCC8	Q13216	396 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	FAM209B	Q5JX69	171 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850		Q6YL49	198 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	TMEM189	A5PLL7	270 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	HAX1	O00165	279 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	RCHY1	Q96PM5	261 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		15.72	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		15.71	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850		A0A1B0GUT8	65 aa		15.71	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	15.71	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	PRR31	Q5SQ13	230 aa		15.71	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		15.71	■□□□□ 0.11
ME2-216	ENST00000639850	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		15.71	■□□□□ 0.11

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