RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 ZNF479Q96JC4 524 aa8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.87□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.86□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 C7orf71A4D174 169 aa8.86□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.86□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 TSPAN13O95857 204 aa8.86□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 RAB9AP51151 201 aa8.86□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.86□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 ARPC1AQ92747 370 aa8.86□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 SPSB4Q96A44 273 aa8.86□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 SLC25A22Q9H936 323 aa8.86□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 F2Z2F3 143 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 HSBP1O75506 76 aa8.85□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 NAPSAO96009 420 aa8.85□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 IGHG4P01861 327 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 GPR183P32249 361 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 OCC1Q8TAD7 63 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
HCG18-241ENST00000602290 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.85□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.84□□□□□ -0.99
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HCG18-241ENST00000602290 FAM231BA6NCW3 169 aa8.83□□□□□ -1
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HCG18-241ENST00000602290 IGLV1-47P01700 117 aa8.82□□□□□ -1
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HCG18-241ENST00000602290 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 TMEM42Q69YG0 159 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 C5orf30Q96GV9 206 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 ZNF714Q96N38 554 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 DERL1Q9BUN8 251 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.81□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 LY6LH3BQJ8 138 aa8.81□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.81□□□□□ -1
HCG18-241ENST00000602290 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
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