RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIFOQ8TCI5 191 aa12.78□□□□□ -0.36
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.69□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa12.68□□□□□ -0.38
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF224P0DH78 156 aa12.68□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF575Q86XF7 245 aa12.68□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF182Q8N6D2 247 aa12.68□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.68□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC5AQ9NY25 188 aa12.68□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.67□□□□□ -0.38
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.67□□□□□ -0.38
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