RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	FA2H	Q7L5A8	372 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF843	Q8N446	348 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	NAGK	Q9UJ70	344 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SZT2	Q5T011	3432 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SYT8	Q8NBV8	401 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SMPX	Q9UHP9	88 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	PLCE1	Q9P212	2302 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	MLANA	Q16655	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	LCN12	Q6JVE5	192 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		Q6YL49	198 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	PRR25	Q96S07	402 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	FSHB	P01225	129 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		Q8N2B8	174 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		H3BUX3	64 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	FOXC2	Q99958	501 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SLA	Q13239	276 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	BATF	Q16520	125 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	LEMD1	Q68G75	181 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		J3QKU1	62 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	CDSN	Q15517	529 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	GLMP	Q8WWB7	406 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		H0Y8G0	127 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	ORMDL3	Q8N138	153 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667		M0R381	172 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	VAMP8	Q9BV40	100 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM23-233	ENST00000557667	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		6.59	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CDKN1B	P46527	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SLC17A3	O00476	420 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CFHR3	Q02985	330 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		A0A1B0GUS0	222 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	OR4C46	A6NHA9	309 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SH2D1A	O60880	128 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SRI	P30626	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CBLN1	P23435	193 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	AMT	P48728	403 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PTH2	Q96A98	100 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		U3KQK5	164 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667		M0R2Z0	102 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ASIP	P42127	132 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	NDP	Q00604	133 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB125	Q8N687	156 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	REV3L	O60673	3130 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	GCSH	P23434	173 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	GNG5	P63218	68 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC140	Q96MF4	163 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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