RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR31Q5SQ13 230 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UQCC3Q6UW78 93 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C20orf173Q96LM9 149 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DIRC3C9JPN6 131 aa6.37□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCRAP04437 139 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.37□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.37□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.37□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFTA3P0C7M3 94 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1C3P42330 323 aa6.36□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.36□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SGK494Q96LW2 274 aa6.36□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.36□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATG101Q9BSB4 218 aa6.36□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F6UB75 175 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM250H0YL14 139 aa6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERCC8Q13216 396 aa6.35□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F8W036 122 aa6.34□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRNTQ86SH4 94 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FMC1Q96HJ9 113 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VGLL1Q99990 258 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DERL1Q9BUN8 251 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PARLQ9H300 379 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSG8Q9UQ74 426 aa6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATRQ13535 2644 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0J9YX75 114 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBAKDNA6NC62 111 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD7P09564 240 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNG4P50150 75 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF138P52744 262 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAS2R60P59551 318 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF124Q15973 351 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BAGE2Q86Y30 109 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00477Q96M19 166 aa6.33□□□□□ -1.4
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