RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PACS1-205ENST00000527224 MEOX1P50221 254 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 PRR7Q8TB68 274 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TWIST1Q15672 202 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ZMAT4Q9H898 229 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ZNF688P0C7X2 276 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CADP27708 2225 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 LYZL6O75951 148 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 HLA-DRB4P13762 266 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 GAGE2BQ13066 116 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 GAGE2EQ4V326 116 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TEN1Q86WV5 123 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 M0R3E3 92 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 LYZP61626 148 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 RITA1Q96K30 269 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CITED1Q99966 193 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 FBXL15Q9H469 300 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 U3KQK5 164 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 Q0VFX4 171 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TTC32Q5I0X7 151 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 RPEQ96AT9 228 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 Q6ZQT7 251 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 SPRY4Q9C004 299 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.67□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 PIFOQ8TCI5 191 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 SPRNQ5BIV9 151 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 A0A087WX48 190 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 ATP5J2P56134 94 aa14.66□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CACNA1EQ15878 2313 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 KALRNO60229 2985 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CTSZQ9UBR2 303 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 CGB1A6NKQ9 187 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 RHODO00212 210 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 GATD1Q8NB37 220 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 PROCRQ9UNN8 238 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PACS1-205ENST00000527224 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SNCGO76070 127 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TCL1BO95988 128 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 POU2AF1Q16633 256 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 OTORQ9NRC9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 CCL4P13236 92 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 M0QXV9 152 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TAL2Q16559 108 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 IFITM1P13164 125 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 EFNA4P52798 201 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SRD5A1P18405 259 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 THAP8Q8NA92 274 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 A8MWV9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 MEIG1Q5JSS6 88 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 KLK15Q9H2R5 256 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 DSCAMO60469 2012 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TNFRSF6BO95407 300 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 CXCL12P48061 93 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SH2D1AO60880 128 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SHISA9B4DS77 424 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 A0A1W2PPI3 338 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SCGB1D4Q6XE38 83 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 RAX2Q96IS3 184 aa14.58□□□□□ -0.07
PACS1-205ENST00000527224 SCGB1C2P0DMR2 95 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS1-205ENST00000527224 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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