RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 FUT9Q9Y231 359 aa9.12□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 HELTA6NFD8 242 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MIFP14174 115 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 DEFB1P60022 68 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.11□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.11□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 LCN15Q6UWW0 184 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.1□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 XCL2Q9UBD3 114 aa9.1□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPV4 95 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 C11orf94C9JXX5 98 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 STAG3L3P0CL85 134 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 BLOC1S1P78537 153 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.09□□□□□ -0.95
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF503Q96F45 646 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.09□□□□□ -0.95
PRAME-212ENST00000485532 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 H3BMM0 161 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 BUB3O43684 328 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 TCTAP57738 103 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 FXYD7P58549 80 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 C12orf74Q32Q52 190 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.08□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.08□□□□□ -0.96
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PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GV50 99 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3-20P01619 116 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 PYYP10082 97 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R45P59539 299 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 KHDC3LQ587J8 217 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 CLLU1Q5K131 121 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 S100A7AQ86SG5 101 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.07□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.07□□□□□ -0.96
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PRAME-212ENST00000485532 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.06□□□□□ -0.96
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PRAME-212ENST00000485532 GCHFRP30047 84 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 S100A7P31151 101 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 CCL20P78556 96 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 FXYD5Q96DB9 178 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 C17orf77Q96MU5 243 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 PAXXQ9BUH6 204 aa9.06□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 CXorf1O96002 111 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 HBE1P02100 147 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 OR10J4P0C629 311 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DRB4P13762 266 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 RAB14P61106 215 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 LINC00052Q96N35 136 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 OR51M1Q9H341 326 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 RNF24Q9Y225 148 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.05□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 H3BQ15 152 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 H3BTX0 84 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 IGLC2P0DOY2 106 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 EMP1P54849 157 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 SUN5Q8TC36 379 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 GPR82Q96P67 336 aa9.04□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 A0A087X0K7 114 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 F6UB75 175 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 TEX46H3BTG2 121 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 M0R2N4 97 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 AMBPP02760 352 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 GALR1P47211 349 aa9.03□□□□□ -0.96
PRAME-212ENST00000485532 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
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