RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 CT45A10P0DMU9 189 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 OR5A1Q8NGJ0 315 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA1O95477 2261 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LYNX1P0DP58 116 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 AMN1Q8IY45 258 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 JKAMPQ9P055 326 aa11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM213A2RRL7 107 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PAX8Q06710 450 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PPM0 123 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf49Q96NF6 230 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 INSIG2Q9Y5U4 225 aa11.76□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IGF2RP11717 2491 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SHISA9B4DS77 424 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CEACAM3P40198 252 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TCTAP57738 103 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 RAB37Q96AX2 223 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 RELNP78509 3460 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM189A5PLL7 270 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01560Q8TB33 94 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.75□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TNFRSF14Q92956 283 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 M0R3E3 92 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NMUP48645 174 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FXYD7P58549 80 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PCP2Q8IVA1 136 aa11.74□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FAM90A27PA6NNH2 459 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FBXL15Q9H469 300 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 KAAG1Q9UBP8 84 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ATRXP46100 2492 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SH2D1AO60880 128 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 RNF125Q96EQ8 232 aa11.73□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFS7O75251 213 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM17P0DL12 118 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 K7EIM0 57 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 K7ENP7 123 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 NPYP01303 97 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 FABP2P12104 132 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CKS2P33552 79 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PIFOQ8TCI5 191 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.72□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV1-47P01700 117 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 CD3EP07766 207 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 PDE6HQ13956 83 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 DKK2Q9UBU2 259 aa11.71□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IL4P05112 153 aa11.71□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SMIM13P0DJ93 91 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PSMG4Q5JS54 123 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SMKR1H3BMG3 65 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PLGLAQ15195 96 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.7□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 HIGD1BQ9P298 99 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 COX7A1P24310 79 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TWIST1Q15672 202 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 S100A7AQ86SG5 101 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.69□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TM4SF20Q53R12 229 aa11.68□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 B9A039 149 aa11.68□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.68□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TACC2O95359 2948 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 LY6HO94772 140 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CNIH1O95406 144 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 GCSHP23434 173 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RNF5Q99942 180 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 MAP1LC3AQ9H492 121 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ZMAT4Q9H898 229 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 LINC01546A6NGU7 62 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 IGLC6P0CF74 106 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 FXYD2P54710 66 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RPEQ96AT9 228 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 C18orf15Q96N68 181 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PRR25Q96S07 402 aa11.67□□□□□ -0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.9 ms