RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CTRLP40313 264 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 ATOH7Q8N100 152 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CCDC140Q96MF4 163 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 IGHG4P01861 327 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 PAX8Q06710 450 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 Q6AWC8 147 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 Q8TAT8 98 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 VGLL1Q99990 258 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 ZFHX3Q15911 3703 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 TMEM189A5PLL7 270 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 C2orf70A6NJV1 201 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 PRR25Q96S07 402 aa14.91□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 GOSR1O95249 250 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 LINC00614P0C842 121 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CCL19Q99731 98 aa14.9□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 VPS13CQ709C8 3753 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GW15 77 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ZNF138P52744 262 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 GATD1Q8NB37 220 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.89□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 BUB3O43684 328 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV1-69P01742 117 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 SSTP61278 116 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MAJINQ3KP22 176 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.88□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 CSN3P07498 182 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 RAB9AP51151 201 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 A0A087X0K7 114 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.87□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.86□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 RNF182Q8N6D2 247 aa14.86□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TMEM213A2RRL7 107 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGLC3P0DOY3 106 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ATP5G2Q06055 141 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ERCC8Q13216 396 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 PIFOQ8TCI5 191 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TRAV41A0A0B4J266 112 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 PRAC2D3DTV9 90 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 LEPROTL1O95214 131 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 MUC21Q5SSG8 566 aa14.85□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 M0QZK8 103 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 BMI1P35226 326 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 PIEZO1Q92508 2521 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 METTL26Q96S19 204 aa14.84□□□□□ -0.03
USP21-201ENST00000289865 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.83□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.83□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.83□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.83□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.83□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 COL12A1Q99715 3063 aa14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 ATP5J2P56134 94 aa14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 BATFQ16520 125 aa14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 Q6ZN92 141 aa14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.82□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 AMN1Q8IY45 258 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 CACNA1AO00555 2505 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 D6R8Y8 96 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 TRGV3P03979 118 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 OR5AL1P0C617 328 aa14.81□□□□□ -0.04
USP21-201ENST00000289865 LY6EQ16553 131 aa14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms