RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01799 113 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lhx4P53776 390 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab5bP61021 215 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Crisp3Q03402 241 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gfod1Q3UHD2 390 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lypd6Q8BPP5 171 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8VC23 124 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ly96Q9JHF9 160 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TncQ80YX1 2110 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NfybP63139 207 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wnt10aP70701 417 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MyocosQ3UWS6 143 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pgam5Q8BX10 288 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sgms2Q9D4B1 365 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trex2Q9R1A9 236 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chst4Q9R1I1 388 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr284A0A0U1RP76 321 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Syngr2O55101 224 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gnb2P62880 340 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dhrs2Q149L0 282 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10277Q6R5C6 214 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1290Q7TQX8 312 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q80VP5 184 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a3Q920C4 213 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rhebl1Q9D8T3 184 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hspb9Q9DAM3 168 aa11.21□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav4-2A0A075B638 110 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21882J3QN86 361 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lax1Q8BHB3 407 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mr1Q8HWB0 341 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr76Q8VFV2 317 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ManbalQ9D8X0 85 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tbx21Q9JKD8 530 aa11.21□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp292Q9Z2U2 2698 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifitm7G3X9Z2 141 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Grcc10O35127 126 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P04940 107 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P04941 107 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P18526 117 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1509Q7TQQ0 308 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubald2Q8BQH4 164 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wipi1Q8R3E3 446 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MavsQ8VCF0 503 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tex43Q9D9I1 141 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prss37Q9DAA4 237 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr913E9Q716 312 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Csn1s2bP02664 143 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psmb6Q60692 238 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fhl4Q8CDC8 279 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r26Q8R2D7 339 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a6dQ99N07 247 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem107Q9CPV0 140 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mbnl1Q9JKP5 341 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tpsg1Q9QUL7 311 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vax2Q9WTP9 292 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arpc1bQ9WV32 372 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv5-17A0A075B5R1 117 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf431E9QAG8 526 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FmodP50608 376 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tpsab1Q02844 273 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MidnQ3TPJ7 465 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dtx1Q61010 627 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd55Q8BLD6 626 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8C708 225 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abhd5Q9DBL9 351 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp36l1P23950 338 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bmpr1bP36898 502 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taar4Q5QD15 347 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Snrnp40Q6PE01 358 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hapln4Q80WM4 400 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr132Q9Z282 382 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ros1Q78DX7 2340 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TracA0A075B662 137 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm14412A2ARR7 526 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr196E9PYP4 309 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cxcl13O55038 109 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01649 108 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgf7P36363 194 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AmelxP63277 210 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ShbgP97497 403 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp970Q08BU3 522 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tbr1Q64336 681 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BsxQ810B3 232 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aadacl4Q8BM81 407 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 9030612E09RikQ8CE20 140 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab11fip5Q8R361 645 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1412Q8VET3 321 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Il25Q8VHH8 169 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cacna1iE9Q7P2 2199 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ctxnd1A0A1B0GST9 59 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20532G3UXR8 106 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5108J3QP01 101 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8 ms