Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Gfod1Q3UHD2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfod1Q3UHD2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gfod1Q3UHD2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gfod1Q3UHD2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gfod1Q3UHD2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gfod1Q3UHD2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gfod1Q3UHD2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gfod1Q3UHD2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gfod1Q3UHD2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gfod1Q3UHD2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gfod1Q3UHD2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gfod1Q3UHD2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gfod1Q3UHD2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gfod1Q3UHD2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gfod1Q3UHD2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gfod1Q3UHD2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gfod1Q3UHD2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfod1Q3UHD2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gfod1Q3UHD2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfod1Q3UHD2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfod1Q3UHD2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfod1Q3UHD2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gfod1Q3UHD2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gfod1Q3UHD2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gfod1Q3UHD2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gfod1Q3UHD2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gfod1Q3UHD2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfod1Q3UHD2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfod1Q3UHD2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gfod1Q3UHD2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gfod1Q3UHD2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gfod1Q3UHD2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gfod1Q3UHD2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gfod1Q3UHD2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gfod1Q3UHD2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gfod1Q3UHD2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gfod1Q3UHD2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gfod1Q3UHD2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gfod1Q3UHD2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gfod1Q3UHD2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gfod1Q3UHD2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gfod1Q3UHD2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gfod1Q3UHD2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gfod1Q3UHD2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gfod1Q3UHD2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gfod1Q3UHD2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gfod1Q3UHD2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gfod1Q3UHD2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gfod1Q3UHD2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gfod1Q3UHD2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gfod1Q3UHD2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gfod1Q3UHD2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gfod1Q3UHD2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gfod1Q3UHD2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gfod1Q3UHD2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gfod1Q3UHD2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gfod1Q3UHD2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gfod1Q3UHD2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gfod1Q3UHD2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfod1Q3UHD2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfod1Q3UHD2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfod1Q3UHD2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfod1Q3UHD2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfod1Q3UHD2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfod1Q3UHD2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfod1Q3UHD2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfod1Q3UHD2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfod1Q3UHD2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfod1Q3UHD2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfod1Q3UHD2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gfod1Q3UHD2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gfod1Q3UHD2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gfod1Q3UHD2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gfod1Q3UHD2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfod1Q3UHD2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gfod1Q3UHD2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gfod1Q3UHD2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfod1Q3UHD2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfod1Q3UHD2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfod1Q3UHD2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gfod1Q3UHD2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gfod1Q3UHD2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gfod1Q3UHD2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gfod1Q3UHD2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gfod1Q3UHD2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gfod1Q3UHD2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gfod1Q3UHD2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gfod1Q3UHD2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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