Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
P01649 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
P01649 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
P01649 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
P01649 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28■■■□□ 2.07
P01649 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P01649 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
P01649 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
P01649 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
P01649 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
P01649 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
P01649 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P01649 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
P01649 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
P01649 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P01649 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
P01649 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P01649 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01649 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P01649 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P01649 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01649 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
P01649 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01649 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P01649 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01649 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01649 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
P01649 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
P01649 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P01649 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P01649 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
P01649 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
P01649 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P01649 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01649 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P01649 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P01649 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
P01649 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P01649 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
P01649 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
P01649 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P01649 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P01649 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
P01649 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P01649 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P01649 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P01649 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P01649 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P01649 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P01649 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
P01649 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01649 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01649 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P01649 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P01649 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01649 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
P01649 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
P01649 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01649 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01649 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01649 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01649 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01649 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01649 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01649 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01649 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01649 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01649 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01649 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01649 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01649 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01649 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01649 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01649 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
P01649 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01649 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P01649 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P01649 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01649 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01649 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01649 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01649 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01649 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01649 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
P01649 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01649 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01649 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01649 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01649 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01649 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01649 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01649 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01649 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01649 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01649 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01649 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01649 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01649 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01649 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01649 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms