RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.69□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 HLA-DQA1P01909 254 aa3.68□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa3.68□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 C3orf56Q8N813 242 aa3.68□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 CCL5P13501 91 aa3.67□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.67□□□□□ -1.82
TSG101-211ENST00000580814 OR2T2Q6IF00 324 aa3.67□□□□□ -1.82
TSG101-211ENST00000580814 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa3.67□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
TSG101-211ENST00000580814 C15orf56Q8N910 161 aa3.67□□□□□ -1.82
TSG101-211ENST00000580814 UPK3BQ9BT76 320 aa3.67□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.66□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 IGHV4-34P06331 123 aa3.66□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.66□□□□□ -1.82
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TSG101-211ENST00000580814 ALKAL2Q6UX46 152 aa3.65□□□□□ -1.83
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TSG101-211ENST00000580814 CLDND2Q8NHS1 167 aa3.65□□□□□ -1.83
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TSG101-211ENST00000580814 DSCR8Q96T75 97 aa3.65□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 ZNF222Q9UK12 451 aa3.65□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 COL18A1P39060 1754 aa3.65□□□□□ -1.83
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TSG101-211ENST00000580814 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.65□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 KIF13AQ9H1H9 1805 aa3.65□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.64□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.64□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.64□□□□□ -1.83
TSG101-211ENST00000580814 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.64□□□□□ -1.83
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TSG101-211ENST00000580814 C11orf94C9JXX5 98 aa3.64□□□□□ -1.83
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