RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553077.5

NFATC3-208, Transcript of nuclear factor of activated T cells 3, human

TSL 2

Gene NFATC3, Length 3,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFATC3-208	ENST00000553077	RAB5C	P51148	216 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	DEFB131A	P59861	70 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	KHDC3L	Q587J8	217 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077		A0A1B0GW64	132 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	TEX22	C9J3V5	150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077		H0Y8G0	127 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	PAX5	Q02548	391 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NFATC3-208	ENST00000553077		A0A087X0M5	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077		A0A1B0GX30	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MPDU1	O75352	247 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	GPX1	P07203	203 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	S100A2	P29034	98 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	DERL1	Q9BUN8	251 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077		A0A1B0GV90	55 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077		K7EIM0	57 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	ERCC8	Q13216	396 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LINC01006	Q8NI28	216 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LY6L	H3BQJ8	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	NDUFA6	P56556	154 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	RNF2	Q99496	336 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	KNCN	A6PVL3	124 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	EDN2	P20800	178 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077		Q9H3A6	140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	ID1	P41134	155 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	RHEB	Q15382	184 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	XCL2	Q9UBD3	114 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	OVOL1	O14753	267 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	IGKV1-17	P01599	117 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	BCL2	P10415	239 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	PAX2	Q02962	417 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LINC01619	G3V211	115 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	IGLC1	P0CG04	106 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	VAX2	Q9UIW0	290 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LYL1	P12980	280 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	IGHG2	P01859	326 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	COMMD1	Q8N668	190 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	SLC17A3	O00476	420 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CSN3	P07498	182 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CTSG	P08311	255 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	NPB	Q8NG41	125 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CXorf65	A6NEN9	183 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	IFITM10	A6NMD0	228 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	HOXA5	P20719	270 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	PIFO	Q8TCI5	191 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MBD6	Q96DN6	1003 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	USMG5	Q96IX5	58 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	GZMB	P10144	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	C14orf144	Q96I85	54 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	LINC00477	Q96M19	166 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	ZNF124	Q15973	351 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	STH	Q8IWL8	128 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		7.29	□□□□□ -1.24
NFATC3-208	ENST00000553077		H3BQ15	152 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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