RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482195.5

DDX39B-220, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-220ENST00000482195 A0A0J9YY99 117 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-220ENST00000482195 CBY3A6NI87 242 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-220ENST00000482195 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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DDX39B-220ENST00000482195 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.18□□□□□ -1.26
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DDX39B-220ENST00000482195 CTDSP2O14595 271 aa7.16□□□□□ -1.26
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DDX39B-220ENST00000482195 H7BYZ3 331 aa7.14□□□□□ -1.27
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DDX39B-220ENST00000482195 PITX3O75364 302 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 HYPMO75409 117 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 CXCL3P19876 107 aa7.14□□□□□ -1.27
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DDX39B-220ENST00000482195 ZNF493Q6ZR52 646 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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DDX39B-220ENST00000482195 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 A0A1W2PPQ1 181 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 PRSS46E5RG02 174 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 HOXB5P09067 269 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 SPCS2Q15005 226 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 ESRGQ1W209 222 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-220ENST00000482195 S100A7AQ86SG5 101 aa7.13□□□□□ -1.27
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