RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 C11orf86A6NJI1 115 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 TP53I11O14683 189 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 CST8O60676 142 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 LINC00315P59091 139 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 TEX37Q96LM6 180 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 NAT8Q9UHE5 227 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.37□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 TECTAO75443 2155 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 SPEGQ15772 3267 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 ANK1P16157 1881 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 LAMA1P25391 3075 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 GNRH2O43555 120 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 IGKV2D-28P01615 120 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 GPX2P18283 190 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 NFYBP25208 207 aa3.36□□□□□ -1.87
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MDM2-201ENST00000258148 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.36□□□□□ -1.87
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MDM2-201ENST00000258148 PFN4Q8NHR9 129 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.36□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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MDM2-201ENST00000258148 THADAQ6YHU6 1953 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 LOC730098B7Z3J9 87 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 M0QZK8 103 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 TRGC2P03986 189 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 BPGMP07738 259 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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MDM2-201ENST00000258148 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.35□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 PIEZO1Q92508 2521 aa3.34□□□□□ -1.87
MDM2-201ENST00000258148 ARL5CA6NH57 179 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TMEM212A6NML5 194 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 DEGS1O15121 323 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OTORQ9NRC9 128 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 CKLFQ9UBR5 152 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 MED31Q9Y3C7 131 aa3.34□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa3.34□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 TLCD2A6NGC4 264 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 PSCAO43653 123 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SYNGR2O43760 224 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 GADD45GO95257 159 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 MSMBP08118 114 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 UCHL1P09936 223 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 DEFA4P12838 97 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 PRR15Q8IV56 129 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OSTCQ9NRP0 149 aa3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 PATJQ8NI35 1801 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OBSL1O75147 1896 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 FRYQ5TBA9 3013 aa3.32□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 A0A1B0GX51 115 aa3.32□□□□□ -1.88
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MDM2-201ENST00000258148 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OR2T1O43869 369 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 FAM107AO95990 144 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 BCL2P10415 239 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 AKR1C3P42330 323 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 OR8B8Q15620 311 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 RTL8BQ17RB0 113 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.32□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 ZZEF1O43149 2961 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 A0A0J9YX75 114 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 J3KT08 172 aa3.31□□□□□ -1.88
MDM2-201ENST00000258148 CITO14578 2027 aa3.31□□□□□ -1.88
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