RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10645Q3UPY1 145 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnase11Q5GAM9 192 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NotoQ5TIS6 240 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr141Q60880 325 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr139Q60891 315 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AdipoqQ60994 247 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AgaQ64191 346 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdkn2aQ64364 169 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp273Q7M6W8 501 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp85Q7TMC9 473 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr153Q7TR48 307 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Harbi1Q8BR93 349 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1394Q8VET2 312 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr960Q8VET5 316 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1155Q8VFR3 314 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pbp2Q8VIN1 187 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plxdc1Q91ZV7 500 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10306Q9CUK2 115 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem128Q9CZB9 163 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gtsf1Q9DAN6 167 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf22Q9ERU3 237 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr34Q9R1K6 375 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf7Q9WTZ1 113 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca4O35600 2310 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Meox1P32442 253 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Id3P41133 119 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1356Q7TQU8 320 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr358Q7TRY5 330 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr305Q7TS02 319 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RTRAFQ9CQE8 244 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lamp5Q9D387 280 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hsd17b11Q9EQ06 298 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tusc2Q9WVF8 110 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CadB2RQC6 2225 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1337A2ACY8 315 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Inafm1E9PV59 130 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21972J3QN38 98 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pet117P0DJF2 80 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C5ar1P30993 351 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3U1D9 316 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam222bQ6P539 562 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp429Q7M6Y0 485 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc37a1Q8R070 531 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r225Q8R2A5 298 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a6cQ99N08 217 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efcab10Q9D581 132 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r54Q9EPB8 315 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trem3Q9JKE1 183 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9047B9EJX3 177 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfsf12O54907 249 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PpyP10601 100 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psg19Q4KL31 475 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr875Q7TRE5 310 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc16a13Q8CE94 428 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem147Q9CQG6 224 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map1lc3bQ9CQV6 125 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bpifa5Q9CQX3 270 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf115Q9D0C1 305 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ap1s2Q9DB50 160 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NagkQ9QZ08 343 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dscaml1Q4VA61 2053 aa11.24□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Obp2bA2BHR0 176 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r194J3JS27 296 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SncaO55042 140 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IfngP01580 155 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CryzP47199 331 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 StumQ0VBF8 141 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp872Q3UVL3 465 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ypel4Q65Z93 127 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PirtQ8BFY0 135 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr368Q8VF22 327 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr473Q8VG44 310 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab5aQ9CQD1 215 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cst7O89098 144 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tctn2Q2MV57 700 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IdnkQ8R0J8 184 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1370Q8VFG4 316 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cds2Q99L43 444 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atoh7Q9Z2E5 149 aa11.23□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc3cA0A1B0GRI5 255 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1274-psA0A1L1SQ02 309 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp972A2AW65 139 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Reg2Q08731 173 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PjvkQ0ZLH2 352 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ang4Q3TMQ6 144 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd96Q3U0X8 602 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp941Q3URY5 674 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trat1Q3UU67 187 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arl13aQ9D416 372 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prr30Q9D9B7 401 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A286YDM5 308 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01659 112 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01796 113 aa11.22□□□□□ -0.61
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01797 113 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9 ms